Без понятия, кто вообще в персонале Nerv, кроме Гэндо и Фуюцуки, будет заморачиваться над содержанием клона после того, как его главное предназначение (пробуждение Евы-01) фактически было выполнено. Ведь первоначально, согласно первым двум фильмам Рей для этой цели и создавалась.
Не, домысливать разумеется можно что угодно, хоть Рей со справкой об LCL-инвалидности, хоть Аску, которую восстанавливают из разрушенной капсулы в очередного клона.