Как вариант. Синдзи не Бог. Он человек с правами Бога. Это создаёт проблемы. Сознательно, он может быть и хотел бы построить другой мир. Но подсознательно - чувствует себя виноватым. Он понимает, что иллюзия нового мира - не исправит грехи и ошибки старого, которые ему исправить просто нельзя. И просто наказывает сам себя. Что ещё важнее, у него так нет необходимого для создания позитивного мира - позитивного опыта, он вынужден жонглировать частицами реальности старого мира. Как их не переставляй, из Ада - Рай не сделаешь. Он пытается найти рабочее решение, но не находит. Можно сказать, что у него просто нет полного контроля над процессом сиквелизации. Нить его судьбы оборвалась и теперь он живёт в Проклятом Евангелионе, который сам же и создал. В этом и состоит настоящий парадокс комплиментации: создать идеальный мир, он может только собрав самого себя по частям по обрывкам мнений о себе других людей, чья общая воля привела мир к той катастрофе с которой он и пытается бороться.