Недождался я таки новых сабов. Посмотрел с сабами с экранки.
Мои предположения из того, что я увидел. Как минимум про те события 14-ти лет, которые толком не упоминались.
Судя по тому:
1) как NERV не плохо обстреливали
2) кладбище из тяжёлой бронетехнике, которые валялись где-то в районе Токио-3
3) различных существ внешне схожих с Евами, из флешбеков
Можно предположить: Третий Удар был. Но не тот, что показали в 2.22. Несколько позже процесс снова запустили каким-то образом, при этом с пробуждением Лилит. С помощью Евы-01 и/или Синдзи или без - уже вопрос. Так же понятно, что в окрестностях Токио-3 явились существа похожие на Евы. Судя по всему, их пытались остановить обычными средствами (вспоминаем брошенную бронетехнику), штурмуя NERV. Насколько удачно - неизвестно. Скорее всего не очень, раз Гендо всё ещё восседает. Возможно, он получил возможность управлять этими "Евами" и Немезидами, против которых никто ничего толком не может сделать. По этой причине NERV живёт и здравствует.
Так же можно сделать вывод, что мир погрузился в ещё большой тотальный звиздец, чем он был во времена первых двух частей. Скорее всего от человечества осталось совсем малая горстка и ресурсы крайне ограничены. Williy - фактически военизированная организация, призванная уничтожить NERV. Судя по тому, что ей переданы такие значительные силы, значит такое понятие, как государство и вовсе исчезло.
В общем и целом... скорее всего Синдзи напрямую с тем тотальным песцом в мире никак не связан напрямую, лишь косвенно. И, у меня такое ощущение, что нам всё поведают теми-же флешбеками о прошлом в следующем фильме.