Там Кадзи вроде говорил что "они начали подозревать, что он доставил зародыш Гендо" и поэтому не факт что у SEELE он был,а узнать о его существовании они могли позже.Либо они рыскали по всей Антарктики в поисках адама(зная что он превратиться в нечто подобное),но Гендо оказался проворнее и скрыл свою находку.