Может то, что он о нём нифига не знал? Или по-твоему Юй ему в потребностях: что, где, когда, - расписала?
Если ошибка в условии задачи - то и ответ, естественно, будет выгладить, как бред. Читай выше.
По ЕоЕ и манге: Гендо не волновал конец света(может он собирался просто вытащить Юй, а потом всё вернуть?), но из-за того, что Рэй пошла спасать Синдзи, а не вызволять Юй, - ритуал пошёл по плану Юй/зееле.