Тогда выходит несостыковка в виде Рей - из чьего биоматериала (помимо Юи) ее создали, плюс чья душа тогда была в ее теле.Вспоминается, что к наброскам несбывшегося превью 3 Ребилда были пометки, что там Каору встречался с четырьмя клонами Рей - это от них были на полу те четыре тени (в превью сцена значилась как "Собрание детей Seele. Не входить") - и можно предположить, что эти клоны несли в себе души четырех Адамов (только такое предположение насчет этой встречи приходит)... но тогда все становится еще запутанней.
P.S. про последнее (встречу Каору с клонами Рей) вычитал отсюда http://ambiguous-anonymous.tumblr.com/post/78568296146
P.P.S. насчет Евы Марк-06 - в раскадровке ко 2 фильму (а вот тут пруфануть не выйдет - инфа со статьи о Марке-06 с евагикс) указано, что при Втором Ударе на луну попал гейзер крови с Антарктиды, где были пробуждены четыре Адама (мб на дисках Реанимедии этот отрывок будет в доп. материалах - на диске первого раскадровки были) и на месте кровавого пятна был создан Марк-06, потому насчет того, что Ева-06 - Лилит есть сомнения. Хотя интересным выглядит то, что глава Seele связывал исполнение "контракта с Лилит" именно с этой Евой.