@AngelSachiel, Каору мог винить Синдзи в ТУ, имея какие-то свои мотивы. Как вариант - почувствовать себя виноватым и рассказать о возможности всё исправить, тем самым заманить его в Еву. Каору просто не может не знать, как именно произошел ТУ. Всех его подробностей - как, к примеру, с копьями, - да, мог не знать, ведь в продолжении участвовал автономный юнит, но он сам лично остановил Сина.
На счет участия Евы-01 в продолжении - навряд ли это так, тяжело представляется её участие в этом процессе, а если учесть, что в ребилде Ева-01 является также Адамом(об этом чуть ниже), то, соответственно, её участие не требуется. А тело Лилит могло принять такую форму из-за автопилота, в роли которых выступают пустышки Рей. На счет WILLE - интересно, но звучит неубедительно, т.к. нигде не показывалось, чтобы кто-нибудь из WILLE как-то контактировали с SEELE, а SEELE в свою очередь ни разу не упомянули WILLE, за исключением Гендо в конце фильма.
Аянами и плеер
Таки она его не подняла, этого момента не показали, как усомнился Пис, но было бы вообще супер.)
На счет Акаги и Фуюцуки - они могут просто не знать всех подробностей, как зритель.
Аска и ее заражение ангелом
Есть мнение, что пилоты в ребилде людьми (нормальными людьми) быть перестают, отсюда и объяснение тому, почему Аска называет людей "Лилим", хотя и причин может быть много. В теории, Аска могла бы попробовать увеличить мощность своего АТ-поля - исходя из Манги, когда Гендо проглотил зародыша и остановил пули солдат JSSDF АТ-полем. Но подтверждений этому нет, так как в ребилде таких сцен нигде не было. На счет капсулы - я думаю, это предусмотрено ее устройством на случай экстренного чего-нибудь там. Но теория об утере их нормальной человечности мне нравится, и я бы хотел применить ее кое-где.
Итоги ТУ
Здесь тяжело сказать, как именно ангел попал в Марк-06, но я всё же склоняюсь к тому, что он был запечатан юзерами для осуществления удара. Ну а новые формы жизни могли быть и созданы из-за того, что сам Марк-06 является Адамом.
Ева-01 - Адам
Из переписки с @triptofun
Также в ребилде ни разу не упомянуто то, что Ева-01 является клоном Лилит.
+ еще пища для размышлений: один из Адамов во флешбеке имеет три глаза, как и Ева-01 в момент пробуждения.
Хотя, это может быть обычное свечение от рога.