Ее легко могло отбросить ударной волной, а когда образовавшееся пространство начало заполнять вода она могла с потоком вернуться к тому месту где встретила Синди(ну или он ее).
К тому же (вспоминаем битву с Израфилом) у Ев кончилась энергия, а значит АТ поле неработает, однако взрыв они выдержали(даже краску не поцарапали)
А еще вспомним 20 эпизод, Синди материлизовался голым, (да и все кто вернется из ЛСЛьного киселя так же будут без одежды, они могут ведь восоздать только свою оболочку, а не предметы).
P.S.Синди в одежде потому, что его катапультировали из Евы-01 он тоже нерастворился, а находился там разумом(разговор с Рей)
Что касается рук Рей-Лилит. Души стремяться к Черной луне(т.к. это источник жизни на земсе все что рождено от луны должно вернуться к ней), но Рей-Лилит вбирает их в себя объединяя их в единое сознание недовая проникнуть в Черную луну