Вернусь к своей версии... Если Митя допускает возможность делимости души... А в одном из ФАКов я нашел вот что
When Asuka's mother carried out the experiment with the Eva's core, only part
of her soul -- the maternal component that loves her daughter above all else --
remained within Eva Unit 02. This is the reason why she could not recognize her
daughter.
Иными словами в 02 не именно МАТЬ АСКИ, а не полностью Киоко...
Почему же не допустить, что в прототипе жена Гендо, а в 01-й мать Синдзи?
Это объясняет
* идентичные результаты Рей на 00 и 01
* заниженные , но ненулевые результаты Сина на 00
* попытки 00й прибить Рицку
* слова, что технологии МАГИ и Евы совпадают
Это не объясняет
* как Юй без части души жены (супруги Гендо) проводила эксперименты далее.
А может просто потеряв женщине матери сводит с ума, а потеря любви к мужу не так критична...
СОРЦ - http://www.animenation.net/forums/showthread.php?t=188682