Да вроде нет единой трактовки. Дело в том что в японской религии, синтоизме. душа может посылать свой образ любимому человеку. Логично предположить, что душа Рей жива. А может ли она вернуться - это дискуссионный вопрос. Думаю, преобладает версия что может, я например считаю что может, но не захочет.
Что касается версий - тысячи их. Есть версия что Кадзи убила Мисато, что Рей, Синдзи и Гендо - воплощение Святой Троицы, а читая например эту статью я несколько раз сползал под стол. Не думаю что стоит относиться к этому серьёзно, но всё это показывает как широко можно трактовать произведение. Помни, что чтобы другие не сказали, ты можешь трактовать неочевидные моменты как считаешь нужным.