Вообще, по-моему, большой вопрос, что там Рей чувствовала к Икари-старшему...Я лично сомневаюсь, что она его любила. Просто он был практически единственным, кто с ней общался так или иначе до появления третьего дитя. Ну и про чувства Юй у нее внутри забывать тоже не стоит.
А вот к Синдзи она относилась по-настоящему тепло. Любовью в полном смысле слова тоже конечно сложно назвать, но все же...