Глядя на бардак, что творится в NERV, Гендо решает взять ситуацию в свои руки и навести порядок. Он приходит в квартиру, где когда-то жила Мисато и увозит в NERV HQ одинокую и грустную Аску, ничего ей не говоря. Ровно с таким же спокойствием Гендо запирает пилота в одном изоляторе с Синдзи. С фирменной ухмылкой главнокомандующий возвращается в свой кабинет, где получает пулю в лоб от наемника SEELE 02. В это же время Альвад проходил обследование у доктора Акаги, а Кадзи, в очередной раз проникнув в архив NERV, проверил личное дело ВладимиРея. Вероятно, он стал на шаг ближе к истине.
В живых остались l0kki
Мелькор
Александр...
ВладимиРей - проверен Кадзи
Альвад - защищен доктором
Rozevir
Mercurialla
Мертвые и изолированные
BabyRage - второе дитя, заперт в изоляторе Гендо.
Veider - проверен Кадзи. Гендо, убит SEELE 02
Sora Deus - Мисато, убита Гендо.
Pizz@ - третье дитя, посажен в изолятор в результате общего голосования.
В игре SEELE 01, SEELE 02, SEELE 03. NERV: Фуюцуки, Рицко и пилот. Кадзи, преследующий свои собственные цели.