В очередной раз пересмотрев Сериал, сложилось такое впечатление:
Аска любит Синдзи. Например, в дирактах, когда ее психоатаковали, нам были показаны кадры, где указывалось на то, что она имеет чувства к Синдзи. К примеру, где она с виноватым лицом чуть ли не плачет после "теперь это неприступная стена Иерихона", а также после ее поцелуя с Синдзи, когда она демонстративно полоскала рот.
А у Синдзи наоборот, чувств к Аске нет, ему явно нравится Аянами.
Так что любовь тут если и есть, то она односторонняя, не взаимная.