"Тихая" комната не сводит с ума только конченного психопата, так что ИМХО - это обычный карантин.
Быть может за металлической дверью даже промелькнет лицо Мисато со словами утешения: "Извини, мол Синдзи, но так необходимо", а сама сразу после этого полезет в конечную догму добывать правду (вроде кадр с Мисато в догме был еще в конце второго мувика).