Э, ну мы так дойдем до того что ключ нужен для облегчения Ангелам захвата Ев. Ведь, пока Кадзи не привез чемоданчик, никаких Ев не захватывалось. А как привез, так Ангелы целых две зохавали, да еще одну заразить попытались. А что, может это на самом деле такой хитрый план. Сначала заставляем Бардииала захватить 03 с Аской и посылаем в бой Синдзи. А что бы Бардиил просто не протопал мимо бездействующего пилота, заставляем его попытаться заразить еще и 01. В итоге убиваем Аску чужими руками, что бы не мешалась под ногами у Рей. Потом заставляем Бардиила захватить 00, что бы Синдзи побежал спасать Рей и попутно пробудил 01.
Вроде, открытым текстом сказано, что функционировать псевдопилот начал от того что должен же управлять Евой хоть кто-то. Да и не вяжутся как-то псведопилот и размышления о путях к Богу.