В аниме все может быть, тем более инцестом это вряд ли можно назвать. Мы не знаем, была ли Рей чистым клоном или с примесями других ДНК (в т.ч. и ангельскими), да это и не особо важно. В биологии родственные ДНК определяются на основе лишь определенных генов, и ни одна экспертиза не скажет, является ли объект А отцом/матерью объекта Б. Подтверждается лишь факт наличия или отсутствия родства. Дело еще и в том, что у генетических детей синтез белков производится по доминантным генам, а в ДНК есть еще и рецессивные, котоыре не проявляются, и все они могут наследоваться от линии бабушек/дедушек или еще дальше. Так что ребенок может даже не иметь некоторых признаком родителей, или наоборот - иметь такой фенотип, который был своейственен его позапрошлому поколению. Это очень редкое свойство, но оно не исключено, если речь идет о прямом клонировании, когда схлеста ДНК просто не происходит. Короче, дело туманно, мы не знаем всех фактов, так что советую не заморачиваться особо не стоит. Хотя да, генетически гомогенный инбридинг чреват злокачественными мутациями и прочими пакостями, но в НГЕ ничего подобного не было, так что и думать об этом не надо.