Важный момент - когда Каору прибыл к распятой Лилит, МАГИ зафиксировал всплеск АТ-поля, как оказалось, от Рэй. Тут и проявилась сущность ее лилитовской души, что и понял Каору. Даже если бы он и захотел объединиться с Лилит, делать это с пустой оболочкой было бы бессмысленно. С другой стороны, ничего же не случилось, когда Ева-01 схватила Каору. Слияние Адама и Лилит не спровоцирует Третий удар, но как-то повлияет на него. Когда Рэй поглотила Адама вместе с рукой Гендо, ничего не произошло. Если у зародыша не было души, а последний ангел почил в бозе (вместе с последним экземпляром адамовской души), то участие Адама в Третьем ударе вообще не имеет смысла.
Итого - два сценария ТУ - либо ангелы возвращаются к прародителю Адаму и всем здец, либо люди возвращаются к прародительнеце Лилит - и все сливаются в одну счастливую сущность. Объединение Адама и Лилит вроде как ни к чему не приведет. Хотя в сериале упоминалось об из запретном слиянии. Честно, не понимаю, к чему это бы привело, и что вообще нужно для этого слияния.
Воду здесь можно мутить до бесконечности...
В продолжении моих мыслей. Случилось то, чего никто не предусмотрел. Тело Юй с душой Лилит (Рэй) почувствовало боль Синдзи, находящего в теле Лилит с душой Юй (Ева-01). Произошло нечто вроде перекрестной связи, в центре которой был страдающий Синдзи. И Лилит вдруг ощутила что-то типа материнского инстинкта, передавшегося ей от Юй. Может, сыграли личные чувства, ведь Лилит (Рэй-2) под конец уже не относилась к нему равнодушно. Любовь ли ? И вообще могла ли Лилит любить кого-то не как своего дитя, а настоящим чувством любви? Рэй ведь физически человек, подросток, со всеми вытекающими последствиями. Может, я переборщил немного, но... черт ее знает...
По поводу Копья - куда ж без него. Раз Лилит с его помощью сотворила людей (лилим), отрезав им от себя свою плоть, которая и стала людьми, то логично, что с его помощью она и объединит всех людей воедино.