>>Для Мисато, как опекуна и непосредственного командира, целовать Синдзи тоже, казалось бы, совершенно недопустимо.
Читай по буквам: то, что сделала Мисато, хотела сделать именно Мисато. то, что сделала Рицко, хотела от нее Майя. Теперь разница немного более ясна?
>>поэтому привлекать ее как аргумент не очень логично
Когда имеешь дело с военными, логика малоприменима.