Когда он к ним шампунь запустил через перегородку, Аска отозвалась, что он попал ей "в самое нежное место". Должно быть, Синдзи ненароком представил эту картину, при этом про себя осознавая, что конкретно он сам и попал ей в это "самое нежное место", пусть и случайно. А так как Синдзи не имел тесного общения с девушками, от этого и произошёл сей казус. Вопрос только в том, при чём здесь, собственно, Мисато?
А фраза про тепловое расширение - всего лишь часть комедийной составляющей второй четверти сериала, ведь вся серия посвящена именно как раз этому физическому процессу.
UPD: А, Норт уже всё объяснил, ну да ладно.