Действительно как это могло быть? Вроде у нас пока нет информации, что кроме выживания Кадзи, в 2015 году происходило не как в сериале. Так что ПОКА можно предполагать, что все что было до нападения сериек мы знаем. То есть Синдзи узнал, кем является Рей, испугался этого знания и прекратил полностью с ней общаться. Потом был бой с серийками и вливание очередной дозы информации, развитие его любви с Аской... Остается только предполагать, что Рей сама к нему обратилась, но в силу всего, что с ним происходило Син банально не понял, что ему Рей сказала и что она услышала в его словах...