На Мисато не действовало Анти-АТ Поле. Спаслась она за счет уплывания на значительное расстояние от теплового взрыва. Да, душа Синдзи после инцидента с Зеруилом находилась в ядре 01, а тело - в ЛСЛ контактной капсулы. Впоследствии это тело было разлито по полу, а для Синдзи 01 создала новое тело и засунула туда душу. С этого момента в сериале действует Синдзи-2 по аналогии с Рэй-2. Это символизирует. На землю кинули кусочек позвоночника. Далеко не факт, что контактная капсула не была повреждена, далеко не факт, что Ядро не было повреждено. Мне кажется, Серийники, будучи Евангелионами сами, догадались, ЧТО ИМЕННО надо хавать в первую очередь.