Ну так и синий для аниме вполне допустим. Вспомним хоть ту же Шампу из "Ранмы пополам". А то что Рей кому-то Юи напоминает, так ведь и Кадзи папу Мисато напоминает (25 серия).
Попытка вытащить Юи произошла десять лет назад. То есть, сразу после ее смерти. А значит, даже если бы Рей начали создавать в момент смерти Юи, она на тот момент была бы грудным младенцем. Даже если Гендо педофил, воскрешать свою жену в образе младенца - немного чересчур. Что касается пролитой LCL, так ее и в случае Синдзи пролили. И ничего, воскрес как-то.
Кстати, в диркатах Фуюцуки вообще говорит, что Рей - продукт его (а не Гендо) отчаяния.