Гендо хотел воссоединится с Юи, когда души и разум смертных объединяться в едином порыве, расформировав свои тела и получив вечную жизнь. При этом, нахождение их в божественных телах Евангелионов, не явялялось частью плана. И скорее всего, было бы даже вредным и менее перспективным, чем создание нового тела коллективным разумом, которое допускает версия скоплементированных ангелов Мисато.
Забавно. Оказывается, что в Конце Евангелиона - Синдзи создаёт именно Нирвану при посредничестве Рей-Лилит. Вспомним о том, что, фактически, Синдзи создаёт мир без страданий. А такое состояние мироздания в первом приближении, с точки зрения буддизма и будет являться некой глобальной Нирваной. Вы совершенно правы.
Это бы бы коллективный разум, поведение которого, было бы, скорее всего похоже на поведение всего человечества.