Я в свое время смотрел первого под впечатлением, а второго уже относительно спокойно. И всё равно не могу не заметить что образы персонажей во втором несколько более многогранны.
Но помимо этого (тут Розевир вполне все сказал) расширяется мир. Не с помощью трюка с "нашим миром", а с помощью честной и интересной проработки. В первом сезоне мы имели несколько абстрактный Аместрис с его внутренними проблемами. Во вторым мы узнаем что он зажат между несколькими государствами, не всегда мирными, что он на грани войны с Драхмой, узнаем про Ксеркс, родину алхимии, наконец, про "китай". И кстати вдобавок к пространственному получаем и временное расширение, мы можем предположить развитие от Ксеркса до современного Аместриса. В первом же сезоне история начиналась только от первого камня, и даже там изображенное прошлое было довольно нечетким и схематичным, прикрученном слегка торопливо и немножко за уши. Все эти отличия обогащают мир алхимика, делают его более убедительным. Помимо проработанных образов и вполне стройного сюжета. Второй алхимик куда цельнее, он не разваливается на отдельные части. В то время как у первого вполне отчетливо видны швы (там, где манга кончилась). Толком не прописанный еще Жадность, например, в первом сезоне уже вскоре вынужден отчалить. Во втором же он проходит весь жизненный цикл с перерождением и приходит от жадности к дружбе. Вообще любопытны сцены смертей отдельных гомункулов во втором. Как умирает похоть, как умирает Брэдли - вот в эти моменты их образы совсем глубоки.